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      高能生物課 | CRISPR技術(shù)是什么,能編輯人類DNA和RNA?

      本文作者: 溫曉樺 2016-06-09 07:40
      導(dǎo)語:利用細菌的免疫系統(tǒng)搞定病毒

      首先,我們先復(fù)習(xí)兩個熟悉而陌生的概念:

      RNA:核糖核酸

      DNA:脫氧核糖核酸

      原核生物和真核生物的遺傳物質(zhì)是DNA,病毒的遺傳物質(zhì)是DNA或RNA。

      好,去片。

      高能生物課 | CRISPR技術(shù)是什么,能編輯人類DNA和RNA?

      RNA結(jié)構(gòu)圖

      日前,麻省理工學(xué)院腦認知科學(xué)系博士張峰在《科學(xué)》在雜志發(fā)表的研究成果顯示,其團隊首次實現(xiàn)利用CRISPR進行RNA編輯。據(jù)悉,張峰及其團隊發(fā)明了一種靶向作用于RNA而不是DNA的新型CRISPR系統(tǒng),論文題為“C2c2 is a single-component programmable RNA-guided RNA-targeting CRISPR effector”。

      CRISPR系統(tǒng),為目前發(fā)現(xiàn)存在于大多數(shù)細菌與所有的古菌中的一種后天免疫系統(tǒng),以消滅外來的質(zhì)體或者噬菌體,并在自身基因組中留下外來基因片段作為“記憶”,全名為“常間回文重復(fù)序列叢集/常間回文重復(fù)序列叢集關(guān)聯(lián)蛋白系統(tǒng)”。

      具體來說,在生命進化歷史上,病毒的擴散方式是把自己的基因寄生到細菌里,利用細菌的細胞工具來復(fù)制自己的基因(病毒沒有細胞),而細菌為了降解外來入侵的病毒基因,進化出一個能夠把病毒基因從自己的染色體上切除的CRISPR系統(tǒng)——這也是細菌特有的免疫。

      CRISPR利用的突破:從DNA編輯到RNA編輯

      從過去10年開始,科學(xué)家只能利用這個系統(tǒng)研發(fā)出進行DNA編輯的技術(shù),典型的是依靠一個復(fù)合物,該復(fù)合物能在一段RNA(核糖核酸)指導(dǎo)下,定向?qū)ふ夷繕?biāo)DNA序列,然后將該序列進行切除。簡答來說,就是手動輔助細胞免疫,從而進行癌癥治療。

      雷鋒網(wǎng)此前報道,科學(xué)家發(fā)明了CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng),即是通過對一種蛋白Cas9的復(fù)合物進行操作,來對多種目標(biāo)細胞DNA進行切除

      然而,張峰博士這次的技術(shù)突破使得CRISPR系統(tǒng)以RNA為靶向目標(biāo),而不再限于DNA切除免疫

      這要從去年10月說起。

      去年10月,一組來自麻省理工學(xué)院、麻省理工學(xué)院-哈佛博德研究所、美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)、羅格斯大學(xué)的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了C2c2酶。C2c2是一種由RNA介導(dǎo),能定向降解RNA的酶。這種酶可以幫助細菌抵御病毒入侵,而且隨著科學(xué)家的進一步研究發(fā)現(xiàn),C2c2酶可以用來剪切細菌細胞中特定的RNA序列。

      只以RNA為目標(biāo),這允許其高通量地精確操縱RNA。這有什么好處呢?我們都知道,病毒是一種沒有細胞結(jié)構(gòu)的最低級的生命體,最簡單的病毒中心是核糖核酸(RNA)。而在植物病毒中,除少數(shù)例外(如花椰菜花葉病毒Caulif- lower mosaic virus),幾乎都是RNA病毒。RNA病毒的遺傳物質(zhì)由核糖核酸(RNA)組成。

      DNA是細胞身份與功能的基因組;RNA則是幫助實現(xiàn)這些基因組指令的角色。C2c2僅以RNA為靶向目標(biāo)的特點,能對RNA實施更精準、更大規(guī)模的暫時性操控——可以理解為:擒賊先擒王。更加切中要害地調(diào)控基因功能,能夠促進人類醫(yī)學(xué)上的疾病認知、治療和預(yù)防。

      DNA編輯讓細胞基因組發(fā)生永久性變化,但是這種基于CRISPR的RNA靶向方法可能允許科學(xué)家們讓細胞基因組發(fā)生可根據(jù)需要進行上下調(diào)節(jié)的臨時變化。

      高能生物課 | CRISPR技術(shù)是什么,能編輯人類DNA和RNA?

      C2c2的應(yīng)用前景

      關(guān)于利用RNA及其衍生物進行基因表達干擾的技術(shù)已有先例,比如對同樣參與糖核酸干擾的小分子RNA——siRNA的利用。而基于C2c2酶的RNA編輯將更具優(yōu)勢,應(yīng)用也更加廣泛,比如:

      在特定的RNA序列上添加分子元件(modules),可以調(diào)節(jié)RNA的翻譯功能。

      RNA的翻譯過程中,從DNA轉(zhuǎn)錄后,RNA被信使RNA(mRNA)為基礎(chǔ)合成具有一定氨基酸順序的蛋白質(zhì)。所以這樣一來,隨便怎樣都是對蛋白質(zhì)表達的大規(guī)模干擾。

      比如,也可以:

      利用C2c2熒光標(biāo)記RNA,追蹤它們的運輸。

      當(dāng)然,這只是舉例,為的是說明當(dāng)我們掌握更基礎(chǔ)、精準的生物分子操控技術(shù)后,對上層的生命表達也有了更多施展的空間。

      關(guān)于CRISPR系統(tǒng)的其他研究突破

      本次科學(xué)家的新發(fā)現(xiàn)主要是專攻RNA的C2c2。而除了此前專攻DNA的CRISPR-Cas9,科學(xué)家還發(fā)現(xiàn)了有別于“CRISPR-Cas9”的另一條基因“剪切”之路,更有利于基因編輯后的修復(fù)。

      今年4月底,哈爾濱工業(yè)大學(xué)正式對外發(fā)布,該校生命學(xué)院教授黃志偉及其團隊首次揭示了CRISPR-Cpf1識別crRNA的復(fù)合物結(jié)構(gòu)。

      高能生物課 | CRISPR技術(shù)是什么,能編輯人類DNA和RNA?

      所謂“CRISPR-Cpf1”,是最新被人類發(fā)現(xiàn)的最高效的DNA編輯工具。人類知道DNA這個物質(zhì)由來已久,但是無法控制用以優(yōu)化。眾所周知,人類疾病中的癌癥、艾滋病或遺傳疾病都可以在DNA中找到“答案”,而“CRISPR-Cpf1”就是破解“答案”的關(guān)鍵,只不過,過去人們一直無法掌握這個答案的作用機制。如今,“CRISPR-Cpf1”的運行機制被破譯。

      具體來說,工具“CRISPR-Cpf1”,它能夠直接改造基因——就像文字編輯軟件“修改文檔”一樣來“修正”基因,而不只是暴力切除。這意味著,人類以后可通過對基因進行手術(shù)來根治某些疾病。

      這樣發(fā)展下去,“美國隊長”成真也不是沒有可能的!

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