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| 本文作者： 李雨晨 | 2020-12-07 20:10 |
作為DeepMind的核心“王牌”，Alpha系列絕不僅是挑戰(zhàn)圍棋和游戲而生。
盡管AlphaGo曾在國際象棋、圍棋等項目中取得了超越人類的表現(xiàn)，其研究不僅震驚世界，也兩次登上 Nature。
但是，正如DeepMind首席執(zhí)行官Hassabis所言：
“我們的目標從來就不只是贏得圍棋，而是開發(fā)能夠解決蛋白質(zhì)折疊這類問題的算法。對于我們來說，這真的是一個關(guān)鍵時刻。這個項目就像燈塔，這是我們關(guān)于人和資源的首次重大投資，用于解決一個根本性的、現(xiàn)實世界的重要問題。
AlphaFold就是在這樣的背景下誕生，而且從第一天起，就立志挑戰(zhàn)生物學里的最難問題——蛋白質(zhì)折疊。
經(jīng)過整整兩年的，Hassabis這番豪言，如今終于應驗。
然而，“將會改變一切”的AlphaFold2，現(xiàn)階段畢竟還是一項“競賽成果”，而AI的本質(zhì)還是要落到更為具體的細分行業(yè)中，要面臨諸多的學科研究和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化問題。
在這個過程中，AlphaFold2還有哪些值得我們進一步思考的地方？生物結(jié)構(gòu)學有沒有可能分化出新的細分領(lǐng)域？
因此，我們?yōu)锳lphaFold2準備了產(chǎn)學兩界最為關(guān)注的七大疑問，看完這七大疑問和20多個子問題，你將會認識到一個全新的AlphaFold2和充滿探索前景的生命學科。
1、CASP競賽的目的、歷史
2、AlphaFold2的“勝利”具體體現(xiàn)在哪些項目上？
3、除了AlphaFold2之外，這次CASP競賽還有哪些亮點？
1、蛋白折疊預測的主要意義和應用是什么？主要難點是什么？
2、AlphaFold2主要在哪些技術(shù)問題上取得了突破？在哪些主要問題上還沒有？是否能區(qū)分alternative confirmation，能否區(qū)分monomer、dimer等？
3、AlphaFold2的“勝利”不是天上掉下來的，它在算法、數(shù)據(jù)上都借鑒了此前的哪些主要結(jié)果和方法？華人科學家在中間都有哪些主要貢獻？
1、結(jié)構(gòu)生物學的哪些方向能受益而加速突破？哪些方向會收影響而淡出？
2、結(jié)構(gòu)生物學的研究能夠怎樣幫助AlphaFold2進一步改進？
1、AlphaFold2能否擴展到分子動力學MDS領(lǐng)域？
2、能否應用于蛋白-配體相互作用/對接， 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用？
3、能否應用于蛋白質(zhì)設(shè)計？
1、這個突破對實際應用尤其是藥物開發(fā)的影響、意義是什么？短期能見效嗎？藥廠是不是會開始組建這方面的AI團隊？
2、除了藥物研發(fā)，AlphaFold2還可能在哪些方面有應用？
3、這個突破可能帶來哪些新的商業(yè)和創(chuàng)業(yè)機會？有沒有可能分化出新的細分領(lǐng)域？
1、AlphaFold2算法的成功主要得益于機器學習，深度學習中的哪些重要技術(shù)和突破（例如注意力機制）？如果僅靠增加算力能否進一步突破？
2、AlphaFold2算法當前的局限性在哪里？可能有哪些改進空間？
1、 如果AlphaFold 不開源，學術(shù)界有沒有成立開源組織的計劃？
2、工業(yè)界一些大公司在算法和算力方面都占有絕對優(yōu)勢，那么學術(shù)研究前進的方向在哪里？對于高校中的AI研究人員有什么建議？對于生物研究人員有什么建議？
3、工業(yè)界一些大公司在算法和算力方面都占有絕對優(yōu)勢，對整個學術(shù)界的影響會是什么？如何“擺正”學術(shù)界和工業(yè)界的關(guān)系？
12月8日上午9:30-11:00，由圖像計算與數(shù)字醫(yī)學國際研討會（ISICDM）主辦，雷鋒網(wǎng)、醫(yī)療AI掘金志協(xié)辦的《ISICDM-AI+蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測》主題論壇，將正式在線上開啟。
主題：權(quán)威專家談AlphaFold：DeepMind 到底突破了什么？
時間：12月8日，上午9:30-11:00
主辦單位：圖像計算與數(shù)字醫(yī)學國際研討會（ISICDM）
協(xié)辦單位：雷鋒網(wǎng)、醫(yī)健AI掘金志
關(guān)注《醫(yī)健AI掘金志》，回復關(guān)鍵詞“蛋白質(zhì)”，即可加入微信群，觀看此次線上論壇，同時實時交流與提問。
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